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《专利法实施例细则》第十四条第二款的规定：“专利权人与他人订立的专利实施许可科通，应当自合同生效之日起3个月内向国务院专利行政部门备案。”
首先，专利实施许可合同本质上是一种民事合同，只要符合法定要件，没有无效情形，就是合法有效的。相关的法律法规也没有规定，不备案会影响合同效力，且没有任何规定合同备案系效力性规范，因此，是否备案并不影响专利实施许可合同的效力。
其次，备案仅仅是国家对专利许可行为的管理方式，如果专利实施许可合同没有备案，对于获得许可的人的权利会有一定的影响。